Le terme « paludisme » vient du latin palus, qui signifie « marais ». Pendant longtemps, on associait la maladie aux zones marécageuses, où elle était particulièrement répandue. Le mot « malaria », quant à lui, provient de l’italien mala aria — littéralement « mauvais air ». Avant la découverte du rôle des moustiques, on pensait en effet que la maladie était causée par l’air vicié des régions humides.
Aujourd’hui, on sait que le paludisme est transmis par des moustiques infectés, mais ces deux appellations historiques sont restées dans le langage courant. En français, le terme paludisme est privilégié dans les contextes médicaux et officiels, tandis que malaria est plus largement utilisé à l’international, notamment en anglais ou dans la communication globale.